T4 DNA Ligase(Fast)
REF: MD001
储运条件
-20℃ 保存。
产品组成
组分/规格
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MD001S-200 U
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MD001M-1000 U
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T4 DNA Ligase (5 U/μl)
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40μl
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200μl
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10× T4 DNA Ligase Buffer
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200μl
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1ml
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50% PEG
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200μl
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1ml
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注:1 U=1 Weiss unit
产品简介
T4 DNA Ligase(Fast)由携带T4噬菌体gene 30的 大肠杆菌产生。该酶催化双螺旋DNA或RNA之间的5'-磷酸基团和3'羟基之间形成磷酸二酯键。该酶在双链DNA、RNA或者DNA/RNA 复合物间可修复单链缺刻, 并且可以连接有粘性末端或者平末端的 DNA片段,但对于单链核酸无活性,主要用于限制性内切酶酶切产物DNA片段克隆、基因定点突变与PCR产物克隆、修复双链DNA 缺刻与线性DNA自环化。T4 DNALigase需要ATP作为辅助因子,在室温下完成粘性末端连接反应仅需10分钟。
酶活单位定义
37℃条件下,1 Weiss unit的酶在20 min内催化1 nmol的 [32PPi] 转变为活性炭吸附态。1 Weiss unit等同于约200个粘性末端连接反应单位(CEU)1Weiss Unit-200CEU。1CEU相当于在16℃条件下,30 min内连接50% HindIII 消化后的λDNA片段。
酶活检测条件
酶活在如下反应混合物中进行测试:66 mM Tris-HCl (pH 7.6), 6.6 mM MgCl2,0.066 mM ATP,10 mM DTT,3.3 μM [32PPi]。
质量控制
核酸内切酶残留测试
37℃条件下,将200 U 的 T4 DNA Ligase(Fast) 与 1 μg的pUC19 DNA中温育4 h,未检测出由共价闭合环状DNA转 变为带有缺刻的DNA。
核酸外切酶残留测试
将酶液与双链DNA底物在37℃温育16 h,通过DNA电泳检测双链DNA底物无变化。
蓝白斑测试
室温条件下,使用30 U T4 DNA Ligase(Fast)连接pUC57 DNA/ HindIII,pUC57 DNA/PstI及pUC57 DNA/SmaI消化产物1 h,然后 用E.coli XL1-Blue感受态细胞转化连接产物,检测到少于1%的白斑。
使用方法
1. DNA插入片段连接至载体DNA(粘性末端连接)
①于冰上配制如下反应体系:
试剂
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使用量
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线性化载体DNA
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20~100 ng
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插入片段DNA
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1:1~5:1(片段:载体摩尔比)
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10× T4 DNA Ligase Buffer
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2μl
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T4 DNA Ligase
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1U(0.2μl)
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Nuclease-Free Water
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To 20 μl
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②充分混匀并瞬离,22℃温育10 min。
③取1~5 μl的连接产物用于50 μl化学感受态细胞的转化,或者取 1~2 μl用于50 μl电转感受态细胞的转化。
注:如果连接反应产物用于电转化,应使用离心柱或者氯仿抽提清洁DNA 代替热失活步骤。
2. DNA插入片段连接至载体DNA(平末端连接)
①于冰上配制如下反应体系:
试剂
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使用量
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线性DNA
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20~100ng
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插入片段DNA
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1:1~5:1(片段:载体摩尔比)
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10× T4 DNA Ligase Buffer
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2μl
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50% PEG
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2μl
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T4 DNA Ligase
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5U(1μl)
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Nuclease-Free Water
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To 20 μl
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②充分混匀并瞬离,22℃温育1 h;
③取1~5 μ l的连接产物用于50μ l化学感受态细胞的转化,或者取 1~2μl用于50μ l电转感受态细胞的转化。
注::如果连接反应产物用于电转化,应使用离心柱或者氯仿抽提清洁DNA 代替热失活步骤。
3. 线性DNA自环化
①于冰上配制如下反应体系:
试剂
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使用量
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线性化DNA
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10~50 ng
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10× T4 DNA Ligase Buffer
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5μl
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T4 DNA Ligase
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5U(1μl)
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Nuclease-Free Water
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To 50 μl
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②彻底混匀并瞬离,22℃温育10 min;
③取1~5μl的连接产物用于50μ l化学感受态细胞的转化,或者取 1~2 μ l用于50 μ l电转感受态细胞的转化。
注:如果连接反应产物用于电转化,应使用离心柱或者氯仿抽提清洁DNA 代替热失活步骤。
4. 接头连接
双链寡核苷酸接头经常被用于在插入片段上产生粘性末端。接头 通常包含限制酶识别位点,在连接后经酶切处理产生和克隆载体匹配的粘端。有时候接头已包含与克隆载体匹配的粘端,此时无需在接头连接完成后进行插入片段的进一步处理。
① 于冰上配制如下反应体系:
试剂
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使用量
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线性化DNA
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100 ~500ng
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磷酸化接头
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1~2μg
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10× T4 DNA Ligase Buffer
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2μl
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50% PEG
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2μl
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T4 DNA Ligase
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2U(0.4μl)
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Nuclease-Free Water
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To 20 μl
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②彻底混匀并瞬离,22℃温育10 min;
③在65℃作用10 min或者70℃作用5 min,进行热失活。
注:添加0.5 mM ATP的条件下,T4 DNALigase在伊势久FastCut限制酶切缓冲液中具有100%的活力。因此,接头连接反应时可以在FastCut限制酶切缓冲液中进行,以简化“接头连接-酶切”实验流程。具体方法为:接头连接反应完成后,先失活T4 DNA Ligase,然后向该体系中添加ATP至终浓度0.5 mM,再在体系中加入适量的伊势久快速内切酶,最后使用最适酶切反应温度进行温育即可。
注意事项
1. T4 DNA Ligase(Fast)在浓度高于200 mM的NaCl或KCl中会被强烈抑制;
2. 连接反应液添加量不应该超过感受态细胞体积的10%,不推荐体 系中加入过量的T4 DNA Ligase(Fast);
3. 与T4 DNA Ligase(Fast)结合的DNA可能会在琼脂糖凝胶中出现带移或弥散,为了避免此现象,可以在上样前对酶进行热失活,必要时加入适量的SDS;
4. 聚乙二醇(PEG)能极大地提高平末端连接的连接效率,PEG 4000的推荐添加量是连接体系的5%(w/v);
5. 电转化效率可能通过对T4 DNA Ligase(Fast)热失活或者使用离心柱或 者氯仿抽提纯化DNA方式来提高;
6. 转化子数目可通过延长反应时间至1 h而增加。